Сейчас Бельянинов занимает должность председателя правления Евразийского банка развития (ЕАБР).
26 июля 2016 г. сотрудники ФСБ провели обыски в кабинете Бельянинова и по месту его жительства, а также у его заместителей. Поводом стало дело о контрабанде элитного алкоголя, главным фигурантом которого был владелец компании «Формум» Дмитрий Михальченко. Бельянинов фигурантом дела не был.
28 июля 2016 г. руководитель ФТС ушел в отставку. В октябре 2017 г. премьер-министр России Дмитрий Медведев внес его кандидатуру на пост председателя правления ЕАБР.
В интервью РБК Бельянинов рассказал, что на следующий день после обыска он встретился с Путиным. «Он мне и предложил уйти в отставку.
Он говорит: ты давно просился, такая ситуация», — сказал Бельянинов. Он добавил, что до этого в течение нескольких лет подавал рапорты об уходе.
«Я очень долго работал на этой должности. Это очень ответственная должность, горячая точка такая.
Конечно, я набрал достаточное количество опыта, знаний, ума, с тем чтобы послужить немножко в другом качестве», — рассказал Бельянинов.
Сейчас, по его словам, он не следит за ситуацией на таможне.