Автор сценария к фильму «Приключения в городе, которого нет». Автор ряда телепрограмм. Один из трёх авторов (Аксельрод, Муратов, Яковлев), придумавших в 1961 году легендарную телевизионную игру КВН.
Член Академии Российского телевидения. Член Академии кинематографистов «Ника». Член Союза кинематографистов и Союза журналистов России. Лауреат премии Гильдии киноведов и кинокритиков России (2002). Заслуженный деятель искусств РФ. Доктор филологических наук. С 1994 года — профессор кафедры телевидения факультета журналистики МГУ. Окончил Московский государственный институт международных отношений.
В 1960-е годы Сергей Муратов работал обозревателем в газете «Советская культура» и журнале «Журналист». С 1968 года преподаёт на кафедре телевидения факультета журналистики МГУ[2]. Читает лекции для студентов МГУ, слушателей Высших курсов сценаристов и режиссёров, Института повышения квалификации работников телевидения, студентов Российского государственного гуманитарного университета и Института современного искусства. Участник международных научных конгрессов и фестивалей по телевидению и документальному кино в США, Великобритании и Германии. Входил в число постоянных членов и организаторов авторитетного международного семинара кинодокументалистов (Рига, Латвия). Автор более полутора десятков книг, учебных пособий и программ по проблемам телевидения, медиаобразования. Ему принадлежит свыше 400 публикаций в теоретических сборниках, а также российских и зарубежных научных журналах.Умер 8 фераля 2015 года в Москве после тяжёлой продолжительной болезни