Родился 23 ноября 1956 г. в Челябинске в семье заводского рабочего.
В 1979-1980 гг. учился на подготовительном факультете в Московском государственном институте международных отношений МИД СССР (ныне МГИМО Университет МИД России).
В 1985 г. окончил факультет журналистики Московского государственного университета (МГУ) им. М.В. Ломоносова. В 2009 г. заочно окончил юридический факультет Института экономики и культуры (Москва) по специальности "юриспруденция".
После окончания МГУ вернулся в Челябинск, где в 1985-1986 гг. работал корреспондентом газеты "Вечерний Челябинск".
В 1986 г. переехал в Москву. Был корреспондентом в редакции пропаганды, затем ведущим программ "Время, события, люди", "Человек и закон" на Всесоюзном радио. Тогда же создал радиопрограмму "Карьера".
В 1991-1997 г. работал на телевидении. В 1991 г. перешел на Центральное телевидение СССР, позднее работал во Всероссийской государственной телевизионной и радиовещательной компании (ВГТРК). Являлся автором и ведущим ток-шоу "Карьера" (затем "Конкурс менеджеров"), гостями которой были политики, бизнесмены, представители искусства и культуры.
В 1997-2000 гг. - директор по связям с общественностью Международного фонда экономических и социальных реформ (фонд "Реформа"), который возглавлял Мартин Шаккум.
В 2000 г. занимал пост первого заместителя председателя Комитета (министра) по делам печати и информации Московской области Елены Марковой.
В 2001 г. вернулся на телевидение, где работал вплоть до 2004 г. продюсером информационного вещания на канале НТВ, затем исполнительным продюсером телеканала "Россия".
С 2004 г. по 2007 г. - директор по связям с общественностью Фонда интеллектуальных технологий, который занимался вопросами сотрудничества органов власти с научными и общественными организациями, а также промышленными предприятиями.
После образования в сентябре 2007 г. Следственного комитета при прокуратуре РФ (СКП РФ; руководитель - Александр Бастрыкин) Владимир Маркин был назначен руководителем Управления взаимодействия со средствами массовой информации СКП. В 2008-2009 гг. также занимал должность заместителя председателя редакционной коллегии и главного редактора журнала "Вестник Следственного комитета при прокуратуре Российской Федерации".
В январе 2011 г. на базе СКП РФ был создан Следственный комитет (СК) РФ, федеральный государственный орган, осуществляющий полномочия в сфере уголовного судопроизводства. СК РФ возглавил Александр Бастрыкин.
До июня 2011 г. Владимир Маркин исполнял обязанности главы Управления взаимодействия со СМИ.
С 20 июня 2011 г. по 6 октября 2016 г. - руководитель Управления взаимодействия со средствами массовой информации СК РФ.
Получил широкую известность благодаря ведению активной информационной политики, в частности, в социальных сетях. В комментариях СМИ не только озвучивал официальную позицию СК, но и высказывал свою личную точку зрения на актуальные общественно-политические события.