В 2015-2018 годах административно-хозяйственные расходы фонда составили 857 миллионов рублей.
Наибольшая статья затрат приходилась на оплату труда сотрудников - 81,9%, и не зависела от результатов деятельности фонда, была сопоставима с бюджетом целого моногорода.
Затраты фонда на выплаты персоналу за 2018 год в сумме 258,5 миллиона рублей сопоставимы с исполнением доходной части бюджета города Пикалево Ленинградской области за 2018 год – 192 миллиона рублей.
В целом расходы фонда на выполнение функций проектного офиса и административно-хозяйственные расходы за 2015-2018 годы составили 1,051 миллиарда рублей.