По версии следствия, в 2016 году Денисов предложил руководителю подконтрольного ему образовательного учреждения передать ему взятку за подписание сметы по расходованию причитающихся учреждению федеральных денег на поддержку реализации программы развития образования и принятие решения о перечислении денег на счет.
Посредником выступила супруга чиновника, которая 4 марта 2016 года получила от руководителя учреждения 200 тысяч рублей. Однако ее действия пресекли сотрудники УФСБ России по Алтайскому краю. Денисову поймали с поличным.
Утром 14 марта сотрудники Следкома и УФСБ провели обыски в доме Денисовых , а также на месте работы бывшего вице-губернатора. Оперативники изъяли предметы, документы и материальные ценности, имеющие отношение к расследуемому уголовному делу.
По данным altapress.ru, примерно в 15 часов 14 марта чету Денисовых задержали в порядке ст. 91 УПК РФ. Сейчас они находятся в изоляторе временного содержания, решается вопрос об избрании им меры пресечения. Следователи проверяют супругов на причастность к совершению других коррупционных преступлений.
Таким образом, можно предположить, что стремительная отставка Денисова была связана с появившейся у краевой администрации информацией о грядущем возбуждении уголовного дела. Это произошло на фоне недавнего задержания на тот момент начальника управления ветеринарии Алтайского края Анатолия Высочина.
Напомним, 9 марта Юрий Денисов подал заявление об увольнении по собственному желанию. Губернатор Александр Карлин в тот же день подписал заявление. Источник в краевой администрации заявил изданию "Политсибру", что еще утром 9 марта Денисов не предполагал, что в этот день ему придется написать заявление об увольнении. Источник утверждает, что Денисов уволился "не по своей воле" — в обед ему поступило указание написать заявление "по собственному желанию". Также источник сообщил, что причиной отставки вице-губернатора якобы могли стать нарушения в подведомственной ему отрасли, связанные с госзакупками и повышением квалификации.